在這項研究中，研究人員利用了被稱為類器官的三維器官組織模型，從癌癥基因組圖譜中識別并測試潛在的基因靶點。他們解釋說，癌癥基因組圖譜中有大量的數(shù)據(jù)，但只有一小部分?jǐn)?shù)據(jù)能告訴人們癌癥是如何生長的以及是否可以作為新型藥物靶點。因此，他們需要一種可擴(kuò)展的功能性方法來從驅(qū)動癌癥生長的原因以及是否可以作為靶點方面對數(shù)據(jù)進(jìn)一步深入分析。

 

為了找到引起腫瘤生長的基因，研究人員重點關(guān)注了具有相同基因異常高拷貝的基因組區(qū)域和具有較高RNA表達(dá)水平的基因組區(qū)域。他們利用新型算法進(jìn)一步研究這些基因。隨后，他們在基因組中確定了6種不同癌癥類型的潛在區(qū)域，包括食管癌、口腔癌、結(jié)腸癌、胃癌、胰腺癌和肺癌。接著，他們?yōu)檫@6個器官構(gòu)建了特定的腫瘤類器官，并在類器官中測試了候選基因以觀察哪些基因與生長中的腫瘤有關(guān)。

 

研究人員表示，使用類器官是對此前標(biāo)準(zhǔn)方法的改進(jìn)。通常在細(xì)胞癌癥研究領(lǐng)域所使用的永生化細(xì)胞系在實驗室生長很多年后往往會發(fā)生許多額外的突變，這可能會讓事情變得更加混亂。而利用小鼠機(jī)體測試多種潛在基因是不可擴(kuò)展的，而且測試往往還會花費數(shù)年時間。隨后，研究人員利用慢病毒文庫來篩選類器官。類器官在口腔和食道鱗狀癌中展現(xiàn)出尤為有趣的研究結(jié)果。這兩種癌癥中很少有能利用藥物靶向作用的驅(qū)動基因。此外，研究人員還測試了一種名為FGFR抑制劑的臨床可用小分子在食管類器官中的作用效果，結(jié)果發(fā)現(xiàn)其能明顯縮小腫瘤的尺寸。

 

研究者Salahudeen表示，F(xiàn)GFR3在近一半的食管鱗狀癌中都會發(fā)生擴(kuò)增，且其能與FGFR相互作用，因此這或許能讓近一半的食管癌患者獲益。下一步研究人員將會在食管鱗狀癌患者中調(diào)查現(xiàn)在在臨床中使用的FGFR抑制劑在新的適應(yīng)癥中的使用效果，并繼續(xù)研究研究人員所發(fā)現(xiàn)的其它潛在的基因。綜上，本文研究中，研究人員建立了基于類器官的候選基因組驅(qū)動子的背景篩選策略，其或能在早期腫瘤發(fā)生過程中進(jìn)行一定的功能評估。