紐約大學(xué)科學(xué)家揭示DNA早期分子改變:HiDEF-seq技術(shù)準(zhǔn)確檢測(cè)DNA單鏈突變
紐約大學(xué)Grossman醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家們近日在《Nature》雜志上發(fā)表了一項(xiàng)重要研究,他們介紹了一種名為HiDEF-seq(發(fā)夾雙重增強(qiáng)保真測(cè)序技術(shù))的新型測(cè)序方法,這項(xiàng)技術(shù)能夠以前所未有的準(zhǔn)確度檢測(cè)DNA代碼中早期發(fā)生的分子改變,即在DNA雙鏈中的一條鏈發(fā)生突變之前。
研究人員表示,HiDEF-seq技術(shù)對(duì)于理解健康細(xì)胞和癌細(xì)胞中突變產(chǎn)生的根本原因至關(guān)重要,并且可以幫助我們認(rèn)識(shí)隨著年齡增長(zhǎng),人體細(xì)胞中遺傳突變?nèi)绾巫匀环e累。這項(xiàng)研究為理解DNA突變的最早期階段提供了新的視角。
DNA由兩條鏈組成,每條鏈都由腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鳥(niǎo)嘌呤(G)和胞嘧啶(C)這四種堿基組成。在正常情況下,這些堿基以特定的方式配對(duì)(A與T,C與G),確保DNA代碼能夠準(zhǔn)確復(fù)制并傳遞給下一代細(xì)胞。然而,突變是DNA代碼中發(fā)生的改變,如C-G堿基對(duì)可能突變?yōu)锳-T。
大多數(shù)突變起源于DNA雙鏈中的單鏈變化,但此前的檢測(cè)技術(shù)無(wú)法準(zhǔn)確識(shí)別這些變化。HiDEF-seq技術(shù)以其高精確度在檢測(cè)這些變化方面取得了突破,每分析100萬(wàn)億個(gè)堿基對(duì)時(shí)僅會(huì)產(chǎn)生一個(gè)錯(cuò)誤。更重要的是,該技術(shù)能在DNA單鏈變化轉(zhuǎn)變?yōu)橛谰眯缘碾p鏈突變之前檢測(cè)到這些變化。
紐約大學(xué)的Gilad Evrony博士指出,HiDEF-seq技術(shù)使我們能夠觀察到DNA分子改變的最早期跡象。研究團(tuán)隊(duì)首先分析了患有聚合酶校對(duì)相關(guān)息肉?。≒PAP)和先天性錯(cuò)配修復(fù)缺陷(CMMRD)這兩種遺傳性疾病的患者的健康細(xì)胞。這些疾病與結(jié)直腸癌和其他癌癥的風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān),并且患者的細(xì)胞突變率高于無(wú)癌癥易感性的個(gè)體。
通過(guò)HiDEF-seq技術(shù),研究人員發(fā)現(xiàn)這些患者細(xì)胞中的單鏈DNA變化數(shù)量更多,如T與C的錯(cuò)配取代了正常的G與C配對(duì)。此外,這些單鏈變化的模式與兩種綜合征患者細(xì)胞中已知的單鏈DNA突變模式相似。研究還進(jìn)一步揭示了人類(lèi)精子中單鏈DNA的化學(xué)(http://www.weberwork.com/sell/l_9/)損傷模式,這可能與環(huán)境中誘導(dǎo)的DNA損傷過(guò)程相似。
Evrony博士表示,HiDEF-seq技術(shù)為理解DNA損傷和突變背后的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。隨著細(xì)胞分裂和繁殖,DNA中的單鏈變化不斷發(fā)生,盡管大多數(shù)變化能夠被修復(fù)機(jī)制糾正,但仍有部分變化可能發(fā)展為突變。研究團(tuán)隊(duì)計(jì)劃利用HiDEF-seq技術(shù)構(gòu)建單鏈DNA錯(cuò)配和損傷的全面數(shù)據(jù)庫(kù),這有助于解釋已知的單鏈突變模式。
未來(lái),研究人員希望將HiDEF-seq技術(shù)獲得的單鏈DNA損傷圖譜與產(chǎn)生的雙鏈突變相結(jié)合,以更好地理解并監(jiān)測(cè)環(huán)境暴露對(duì)DNA的日常影響。遺傳學(xué)家估計(jì),每個(gè)人類(lèi)細(xì)胞中大約有120億個(gè)堿基可能受到損傷或錯(cuò)配,因?yàn)檫z傳代碼有兩個(gè)拷貝。HiDEF-seq技術(shù)將為我們提供更多關(guān)于這些變化的信息,并可能引領(lǐng)癌癥治療和預(yù)防的新方向。