最近,發(fā)表在國(guó)際雜志Nature metabolism上,來自威爾-康奈爾醫(yī)學(xué)院等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過研究開發(fā)了一種圖譜,該圖譜編目了腫瘤樣本中稱之為代謝產(chǎn)物的小分子的基因活性和水平,其或能為研究人員識(shí)別癌癥發(fā)生的深層機(jī)制提供一種新方法。
結(jié)合新的數(shù)據(jù)集和現(xiàn)有的代謝產(chǎn)物和基因活性數(shù)據(jù)集,研究人員創(chuàng)建了癌癥代謝圖譜(camp, cancer atlas of metabolic profiles)。這張地圖包含了11種不同癌癥類型的988種腫瘤和正常組織的對(duì)比數(shù)據(jù),通過分析這些數(shù)據(jù),揭示了兩個(gè)主要遺傳和代謝產(chǎn)物之間的關(guān)系,并揭示了其他癌癥的發(fā)生機(jī)制。新的地圖將有助于科學(xué)家們形成對(duì)腫瘤如何運(yùn)作的核心理解。
研究者ed reznik博士表示:“我們的事業(yè)代謝產(chǎn)物和基因表達(dá)水平的變化,如何協(xié)調(diào)起來的基本問題,我們提供的答案,是美好的,通過這種微妙和諧基因編碼的酶及其代謝產(chǎn)物氣質(zhì)分子作用即腫瘤微環(huán)境大使免疫細(xì)胞變?yōu)楠?dú)特的存在出現(xiàn)。代謝產(chǎn)物是在身體組織和血液中的代謝過程中使用或生成的小有機(jī)分子,通常在生化反應(yīng)中起作用,賦予細(xì)胞能量或作為蛋白質(zhì)、糖類、脂質(zhì)、dna和rna的基本組成部分。組織內(nèi)代謝產(chǎn)物的水平模式是生物學(xué)中重要的信息層之一。“
目前研究人員已經(jīng)知道,癌癥中的關(guān)鍵事件(如腫瘤的發(fā)生和抗藥性的獲得)都伴隨著代謝產(chǎn)物的顯著變化。這種癌癥相關(guān)的代謝變化與基因活性的變化聯(lián)系在一起,是科學(xué)家們?yōu)槭裁窗l(fā)生這種代謝產(chǎn)物的變化,有些酶或其他蛋白質(zhì)引導(dǎo)這種變化,以及他有些場(chǎng)合破壞這種機(jī)制是防止癌癥能否有助于理解可以幫助您。
目前研究人員已經(jīng)知道,癌癥中的關(guān)鍵事件(如腫瘤的發(fā)生和抗藥性的獲得)都伴隨著代謝產(chǎn)物的顯著變化。這種癌癥相關(guān)的代謝變化與基因活性的變化聯(lián)系在一起,是科學(xué)家們?yōu)槭裁窗l(fā)生這種代謝產(chǎn)物的變化,有些酶或其他蛋白質(zhì)引導(dǎo)這種變化,以及他有些場(chǎng)合破壞這種機(jī)制是防止癌癥能否有助于理解可以幫助您。
camp database數(shù)據(jù)庫是針對(duì)原發(fā)性腫瘤樣本代謝產(chǎn)物和基因活性水平的最大單一數(shù)據(jù)集,其組合可能會(huì)給科學(xué)家?guī)砗艽蟮奶魬?zhàn),因此開發(fā)了這種分析。研究者krumsiek " rna堿基序列等的研究方法相比,代謝產(chǎn)物研究中所使用的方法的標(biāo)準(zhǔn)化程度要低得多,一般情況下兩種癌癥代謝產(chǎn)物研究測(cè)定不會(huì)代謝產(chǎn)物,甚至同一組兩研究中測(cè)量的代謝產(chǎn)物有時(shí)能在數(shù)據(jù)集中有名稱的差異。
目前,科學(xué)家們正致力于整理各數(shù)據(jù)集的不同特征。通過尋找數(shù)據(jù)集中所有癌癥類型中最明顯的基因-代謝產(chǎn)物之間的關(guān)系,可以揭示更廣泛的癌癥發(fā)生機(jī)制。研究者發(fā)現(xiàn)的一種模式是,與加密酶和其他蛋白質(zhì)的基因密切相關(guān)的代謝物在代謝物的生成和調(diào)節(jié)中起著重要的作用。查明調(diào)節(jié)癌癥相關(guān)代謝產(chǎn)物水平的遺傳基因,將有助于今后對(duì)這些代謝產(chǎn)物在引發(fā)癌癥方面起到重要作用的進(jìn)一步調(diào)查。
在另一個(gè)顯著的模型中,一些代謝物系列的基因與活性化有密切的關(guān)系,基因與代謝物的生產(chǎn)和加工過程有明確的關(guān)系。通過對(duì)其中參與的基因進(jìn)行詳細(xì)的研究,研究者們意識(shí),這種類型可能反映了免疫細(xì)胞的存在,這些免疫系統(tǒng)可以滲透到實(shí)體腫瘤??死肺骺瞬┦空f:“免疫細(xì)胞似乎在大范圍內(nèi)影響腫瘤樣本的代謝產(chǎn)物特征。”這種研究結(jié)果的腫瘤樣本中多種細(xì)胞類型的貢獻(xiàn)度強(qiáng)調(diào)理解的重要性,為此,研究者們腫瘤樣本的正確位置幫你基因活性代謝產(chǎn)物地圖化計(jì)劃著尖端技術(shù)的轉(zhuǎn)型。
本文的研究結(jié)果表明,在細(xì)胞異質(zhì)組織中,基因-代謝產(chǎn)物的共變部分可能來自基因和代謝產(chǎn)物的相互作用。